Parmi les missions primordiales de l'Agence c'est la surveillance et l'entretien des barrages afin de maintenir leur fonctionnement dans de bonnes conditions de sécurité.
Un barrage est un ouvrage vivant, dans le sens où il réagit aux variations de pression (liées aux fluctuations du volume d’eau) et de température.Le dispositif d’auscultation, mené par l'agence, surveille en permanence ces réactions : les résultats des mesures sont comparés aux valeurs calculées par le modèle de comportement de l’ouvrage. Il est alors possible de déterminer si le barrage se comporte comme prévu ou bien si les déformations constatées sont irréversibles et susceptibles de fragiliser la structure.
Par ailleurs, l’exploitant effectue des essais sur les organes d’évacuation des eaux pour s’assurer de leur bon fonctionnement.